人工智能驱动的眼部“衰老时钟”揭示眼病治疗的新路径
为了用小的、可再生的样本收集尽可能多的信息,Mahajan及其团队开发了一种新技术。该技术名为TEMPO,通过追踪蛋白质到其产生的RNA所在的细胞类型,帮助科学家了解致病蛋白质的细胞起源,期望最终能够针对这些细胞进行个性化医疗治疗。
为了深入了解导致各种眼部疾病的细胞过程,研究小组分析了手术期间从局部麻醉患者的房水(晶状体和角膜之间的液体)中提取的液体活检。这些样本来自于患有三种眼病的患者:糖尿病视网膜病变(导致眼睛血管渗漏,进而导致视力丧失)、色素性视网膜炎(损害眼睛后部的感光细胞)以及葡萄膜炎(眼睛内部的炎症)。
Mahajan和团队利用46名健康患者的眼液,训练了一种人工智能算法以预测患者的年龄。研究人员将液体中近6000种蛋白质输入算法,发现其中26种蛋白质可以作为一个群体用于年龄预测。
通过比较患病眼液与健康眼液,研究小组发现,患病眼睛患者的蛋白质显示出更高的“年龄”:早期糖尿病视网膜病变患者的“年龄”为12岁,晚期糖尿病视网膜病变患者为31岁,视网膜色素变性患者为16岁,葡萄膜炎患者为29岁。
该模型还发现,负责指示年龄增长的细胞因每种疾病而异:晚期糖尿病视网膜病变的血管细胞、色素性视网膜炎的视网膜细胞和葡萄膜炎的免疫细胞。
研究小组还发现,一些通常作为治疗目标的细胞并不是与疾病最相关的细胞,这促使对治疗方法进行重新评估。例如,糖尿病药物通常针对血管细胞,因为这些细胞在疾病发展中会渗漏,但研究发现,从健康到晚期糖尿病视网膜病变,巨噬细胞(清除死细胞的免疫细胞)中的蛋白质显著增加。
Mahajan指出,同时针对衰老细胞和疾病细胞可能使治疗更有效,因为这两者似乎是分开作用的,但同时会对眼睛造成损害。Mahajan预计,研究人员将把TEMPO技术和衰老时钟应用于其他器官的液体,如肝脏、胆汁和关节液。
Mahajan希望通过了解这些生物标志物,研究人员能够进行更成功的临床试验,因为他们将对驱动疾病的细胞过程有更深入的理解。目前,90%在小鼠模型或人体细胞中测试的候选药物在临床试验中失败。Mahajan表示,了解导致疾病和衰老的细胞可能会增加成功的机会。
Mahajan总结道:“这就好像我们把这些活细胞拿在手里,用放大镜检查它们。我们正在拨打电话,在分子水平上密切了解我们的患者,这将实现精准健康和更明智的临床试验。”
参考文献:
液体活检蛋白质组学与人工智能相结合,在体内识别眼睛衰老和疾病的细胞驱动因素 - (https://www.cell.com/cell/fulltext/s0092-8674(23)01033-4)
(来源:每日)